あらゆる願いをかなえる「聖杯」をめぐり、魔術師（マスター）と英霊（サーヴァント）が争いを繰り広げた「聖杯戦争」から10年。冬木市で再び聖杯戦争が始まる。前回の聖杯戦争を戦った衛宮切嗣の養子・衛宮士郎は、切嗣の遺志を継いで…